Hallo Grummel,
es gibt eigentlich nur einen Weg.

Das Update auf eine neue Version besteht meistens aus zwei Teilen. Zum einen müssen die geänderten PHP-Scripte ausgetaucht werden und zum anderen muss die Datenbankstruktur angepasst werden.
Wenn du selbst keine Hacks eingebaut hast, kannst du im Grunde das gesamte Verzeichnis von ubbthreads austauschen und auf den Server laden. Falls du Hacks installiert hast, solltest du die vorher in die neue Version einbauen.
Hast du das getan, musst du die "altertables" Scripte ausführen und zwar alle und in der richtigen Reihenfolge.
Die Scripte sind immer so benannt, dass man erkennen kann, welche Version auf welche Version geupdatet wird.
Zuerst würdest du also altertables-6.2.3-6.3.php ausführen, dann und zuletzt altertables-6.4-6.4.1.php